Образовательный процесс в МОУ ЦО №49 проводится по двум программам:

• 1-9 классы  - « Планета знаний» Института новых образовательных систем при РАО;
• 1-11 классы – «Школа России».

10 класс – социально-экономический класс.

         Модули:

• «Обществоведение»;
• «Экономика»;
• «Политика»;
• «Право».